Change, exchange and adaptation. Accessory genome evolution in Fusarium oxysporum

Samenvatting

Plantenziekte vormen een bedreiging voor de voedselzekerheid. Ziekteverwekkers en planten zijn in een voortdurende strijd, waarin planten strategieën ontwikkelen om zich tegen ziekten te beschermen en schimmels zich aan passen om deze afweer te omzeilen. Veel schimmels die plantenziekten veroorzaken hebben een effectieve strategie ontwikkelt: snel veranderende regio’s in het genoom, die tussen soorten kunnen worden uitgewisseld, waardoor ze zich snel kunnen aanpassen; zogenaamde accessoire regio’s. In mijn proefschrift analyseer ik deze accessoire regio’s in de schimmel Fusarium oxysporum, een belangrijke plantenziekteverwekker die vele belangrijke gewassen infecteert, waaronder de banaan – een essentiële voedingsbron in tropische en subtropische regio’s. We identificeren verschillende accessoire regio’s die de capaciteit om ziekten te verwekken met zich mee dragen en we beschrijven de evolutie van deze regio’s. Door dit onderzoek krijgen we inzicht in hoe schimmelpathogenen evolueren en zich aanpassen. Deze bevindingen zijn van belang om de bescherming van gewassen te verbeteren.